El 1 de septiembre de 1997, el obispo D. Carlos Osoro Sierra creaba el Centro Teológico a Distancia «San Martín», como Centro Asociado al Instituto Internacional de Teología a Distancia y extensión del Instituto Superior de Ciencias Religiosas a Distancia «San Agustín», ambos bajo el patrocinio de la Facultad de Teología de la Universidad Pontificia de Comillas.
Cuando el ISCR «San Agustín» se integra en el ISCR San Dámaso como su sección a distancia, el obispo D. Leonardo Lemos Montanet inicia en el curso 2012-2013 un proceso de integración progresiva con el Instituto Superior Compostelano de Ciencias Religiosas (ISCCR), Centro patrocinado por la Facultad de Teología de la Universidad Pontificia de Salamanca. Ese proceso culminaría en el 2016, quedando nuestro Centro como Extensión de aula del ISCCR en la Diócesis de Ourense. Desde ese momento, y hasta el presente, pasará a llamarse Centro de Ciencias Religiosas «San Martín» y contará con un nuevo Estatuto.
Desde el curso 2020-2021 el Centro tiene su sede en las instalaciones del Colegio Seminario Menor A Inmaculada, donde cuenta con una buena infraestructura TIC a la vanguardia de los centros educativos de Ourense, con fácil aparcamiento y accesibilidad a través de medios de transporte público y con las instalaciones propias de un centro de estudios. El Claustro de profesores lo integran principalmente docentes del Instituto Teológico «Divino Maestro» de Ourense.